A ferramenta oferece várias opções de estrutura para organizar seu conteúdo EPUB de forma eficaz. Escolha entre Baseada em Capítulos para uma organização semelhante a livros, Baseada em Tópicos para agrupamento temático, Baseada em Conceitos para agrupamento de ideias, Hierárquica para relações aninhadas, Sequencial para fluxo linear, Radial para foco em tema central, ou Cronológica para arranjo baseado no tempo. Cada tipo de estrutura oferece benefícios únicos dependendo do seu conteúdo e objetivos de aprendizagem.