Aunque la generación de cadenas regex es potente, presenta algunas limitaciones. Los patrones complejos con extensa repetición (como a{60000}) pueden causar problemas de rendimiento o desbordamiento de memoria. Algunas herramientas tienen dificultades con características avanzadas de regex como lookaheads o retroreferencias. Además, generar todas las posibles coincidencias para patrones con muchas variaciones puede producir un número abrumador de resultados, haciéndolo impráctico para patrones amplios.